東京大学物性研究所・井上研究室

口頭発表 | ポスター発表 | 招待講演
Generative Design to Unlock the Potential of Protein Function, Grant-in-Aid for Transformative Research Areas A: The 2nd Area Meeting　December 16-17, 2024 Awaji, Japan

1. Comprehensive understanding of functional expression mechanism and functional improvement of rhodopsins
   ○Keiichi Inoue

The 20th International Conference on Retinal Proteins (ICRP2024)　November 17-21, 2024　Interlaken, Switzerland

1. Spectroscopic study on the absorption spectra and photoreaction of retinal G-protein-coupled receptors, RGRs
   ○Takashi Nagata, Naoya Morimoto, Chunyangguang Li, Keiichi Inoue
2. Xenorhodopsin with a new sequence motif lacking the characteristic proline
   ○Yoshitaka Kato, Taito Urui, Yasuhisa Mizutani, Oded Béjà, Josefa Antón, Keiichi Inoue
3. High-throughput engineering of microbial rhodopsin mutants using an automated liquid-handling system
   ○Masae Konno, Takashi Nagata, Keiichi Inoue
4. ApuRhs, a new family of anion channelrhodopsin from apusomonads
   ○Shunki Takaramoto, Luis Javier Galindo, Takashi Nagata, Andrey Rozenberg, Hiroto Takahashi, Oded Béjà, Keiichi Inoue
5. Electrophysiological characterization of the mechanism of acetate and chloride binding on an artificial inward proton pumping rhodopsin
   ○Zikun Lyu, Shunki Takaramoto, Keiichi Inoue

文科省・学際領域展開ハブ形成プログラム「マルチスケール量子－古典生命インターフェース研究コンソーシアム」第2回合同シンポジウム　2024年11月5日-6日　名古屋

1. 新奇ウイルスロドプシンの分光学的および機能的特性
   ○永田 崇, 宝本 俊輝, Andrey Rozenberg, Oded Béjà, 井上 圭一

1. 新規ゼノロドプシンの機能および物性研究
   ○加藤 善隆, Oded Béjà, Josefa Antón, 井上 圭一

1. Archearhodopsin-3（AR3）変異体における蛍光発⽣メカニズムの研究
   ○今野 雅恵, Krystyna Herasymenko, Stefan Haacke, 井上 圭一

1. Electrophysiological characterization of the mechanism of acetate and chloride binding on an artificial inward proton pumping rhodopsin
   ○Zikun Lyu, Shunki Takaramoto, Keiichi Inoue

日本比較生理生化学会 第46回名古屋大会　2024年9月30日-10月1日　名古屋

1. Functional characterization of novel intracellularly-localizing viral rhodopsins
   ○Takashi Nagata, Shunki Takaramoto, Andrey Rozenberg, Oded Béjà, Keiichi Inoue

第24回日本光生物学協会年会　2024年8月6日-7日　京都

1. 新奇ウイルスロドプシンの分光学的特性と機能解析
   ○永田 崇, 宝本 俊輝, Andrey Rozenberg, Oded Béjà, 井上 圭一

21st IUPAB & 62nd BSJ Joint Congress　2024年6月24-28日　京都

1. Microbial Rhodopsin Engineering through Machine Learning and Automated Experiments
   ○Keiichi Inoue, Takashi Nagata, Masae Konno, Masayuki Karasuyama, Yu Inatsu, Kazuhito V. Tabata, Ichiro Takeuchi

1. Spectroscopic and functional characterization of novel microbial rhodopsins homologous to viral rhodopsins
   ○Takashi Nagata, Shunki Takaramoto, Andrey Rozenberg, Oded Béjà, Keiichi Inoue

1. Study on the Mechanisms of High Fluorescence of Archaearhodopsin-3 (AR3) Mutants
   ○Masae Konno, Krystyna Herasymenko, Stefan Haacke, Keiichi Inoue

1. Interaction Mechanism of α-Synuclein with Synapsin in the Liquid Condensates
   ○Shunki Takaramoto, Keiichi Inoue

1. Electrophysiological Study of the Effect of Weak Organic Acids on the Transport Activity of Proton Pumping Rhodopsin of Rhizobacteria
   ○Zikun Lyu, Shunki Takaramoto, María del Carmen Marín, Hiromu Yawo, Keiichi Inoue

1. Exploration of the Diversity of Absorption Spectra in Vertebrate Retinal Photo-isomerase, RGR
   ○Li Chunyangguang, Takashi Nagata, Naoya Morimoto, Keiichi Inoue
   若手研究者ポスター賞

学術変革領域研究（A) 「1000テスラ科学」領域・第３回領域会議　2024年4月19-21日　京都

1. 紫外領域に吸収を持つロドプシンの磁場効果探索における可能性
   ○永田 崇

日本比較生理生化学会 第45回大阪大会　2023年12月1-2日　豊中

1. The diversity of absorption spectra in vertebrate retinal photo-isomerase rhodopsins
   ○永田 崇、森本 直也、李 春阳光、井上 圭一

第61回日本生物物理学会年会　2023年11月14-16日　名古屋

1. 脊椎動物が持つレチナール光異性化酵素ロドプシン・RGRの吸収波長の多様性
   Diversified absorption spectra in vertebrate retinal photo-isomerase rhodopsins
   ○永田 崇、森本 直也、李 春阳光、井上 圭一
2. 新奇カチオンチャネルロドプシンHulaCCRの機能解析
   Electrophysiological characterization of a novel cation channelrhodopsin HulaCCR with an ET(C)D motif
   ○宝本 俊輝、 Shai Fainsod、永田 崇、Andrey Rozenberg、 Oded Béjà、井上 圭一

学術変革領域研究（A) 「分子サイバネティクス」領域・第3回領域会議　2023年11月10-11日　吹田

1. 微生物ロドプシンを用いた光による人工細胞への高速刺激入力法の開発
   井上 圭一

文科省・学際領域展開ハブ形成プログラム「マルチスケール量子－古典生命インターフェース研究コンソーシアム」キックオフシンポジウム　2023年11月1-2日　柏

1. ロドプシンのプロトン移動ダイナミクスついての分光研究
   ○井上 圭一

1. 新奇光受容タンパク質ベストロドプシンの特異な発色団光異性化反応と構成的研究
   ○永田 崇、川﨑 佑真、今野 雅恵、長坂 勇次郎、青山 真子、片山 耕大、Andrey Rozenberg、Igor Kaczmarczyk、Donna Matzov、Moran Shalev-Benami、Oded Béjà、神取 秀樹、井上 圭一

1. 微生物ロドプシンを用いた植物オプトジェネティクス
   ○今野 雅恵、井上 圭一

1. カチオンチャネルロドプシンChRmineのイオン輸送メカニズム
   ○宝本 俊輝、川﨑 佑真、柴田 桂成、岸 孝一郎、加藤 英明、井上 圭一

1. Electrophysiological characterization of the ion transport mechanism of proton pumping rhodopsin in rhizosphere bacteria
   ○呂 子琨、宝本 俊輝、María del Carmen Marín、八尾寛、井上 圭一

1. Diversity in absorption spectra of retinal photo-isomerase rhodopsins, RGRs
   ○李 春阳光、森本 直也、永田 崇、井上 圭一

1. Exploring counterion pK_a variations in bestehodopsin from Phaeocystis antarctica
   ○劉 一帆、今野 雅恵、井上 圭一

第17回分子科学討論会　2023年9月12-15日　大阪

1. 光駆動型外向きプロトンポンプ型ロドプシンの内向きプロトンポンプへの機能転換
   Marín Pérez María del Carmen、今野 雅恵、八尾 寛、○井上 圭一

8th Asian Spectroscpy Conference 2023　2023年9月3-7日　新潟

1. Twisting and Protonation of Retinal Chromophore Regulate Channel Gating of Channelrhodopsin C1C2
   ○Keisei Shibata, Kazumasa Oda, Tomohiro Nishizawa, Yuji Hazama, Ryohei Ono, Shunki Takaramoto, Reza Bagherzadeh, Hiromu Yawo, Osamu Nureki, Keiichi Inoue, Hidefumi Akiyama

第23回日本光生物学協会年会　2023年8月29-30日　京都

1. 脊椎動物が持つレチナール光異性化酵素ロドプシンRGRの光吸収・反応特性
   森本 直也、○永田 崇、井上 圭一
2. カチオンチャネルロドプシンChRmineのイオン輸送メカニズム
   ○宝本 俊輝、川﨑 佑真、柴田 桂成、岸 孝一郎、加藤 英明、井上 圭一
3. レチナール発色団のねじれとプロトン化によるチャネルロドプシンC1C2のチャネル開閉メカニズム
   ○柴田 桂成, 小田 和正, 西澤 知宏, 挾間 優治, 小野 稜平, 寶本 俊輝, Reza Bagherzadeh, 八尾 寛, 濡木 理, 井上 圭一, 秋山 英文
   ポスター賞受賞

第23回日本蛋白質科学会年会　2023年7月5-7日　名古屋

1. レチナール光異性化酵素ロドプシンRGRの吸収分光特性と可逆的光反応
   森本 直也、○永田 崇、井上 圭一

Time Resolved Vibrational Spectroscopy 2023　2023年6月11-17日　Amsterdam

1. Retinal Chromophore Twisting Regulates Channel Gating of Channelrhodopsin C1C2
   ○Keisei Shibata, Kazumasa Oda, Tomohiro Nishizawa, Yuji Hazama, Ryohei Ono, Shunki Takaramoto, Reza Bagherzadeh, Hiromu Yawo, Osamu Nureki, Keiichi Inoue, Hidefumi Akiyama

第49回生体分子科学討論会　2023年6月1-2日　千里朝日阪急ビル A&Hホール

1. 高熱安定性光駆動型内向きH⁺ポンプロドプシン(MtSzR)の安定化メカニズムの研究
   ○川﨑佑真、今野雅恵、井上圭一

CREST「バイオDX」領域・第2回領域会議　2023年5月11-12日　神戸

1. ロドプシンを基盤としたオプトジェネティクスツール研究の最前線
   ○井上 圭一

第19回レチナールタンパク質国際会議　2022年10月30-11月4日　札幌

1. Molecular characterization of proton-pumping rhodopsin from Saccharibacteria that may use host-derived all-trans retinal
   ○Masae Konno、Alexander L. Jaffe、Yuma Kawasaki、Chihiro Kataoka、Oded Béjà、Hideki Kandori、Jillian F. Banfield、Keiichi Inoue

1. Unique ion transport mechanism by novel chloride pump rhodopsin from soil bacteria
   ○Tomohiro Ishizuka、Kano Suzuki、Yuma Kawasaki、Masae Konno、Takeshi Murata、Keiichi Inoue

1. Conversion of light-driven outward proton pump rhodopsin into inward proton pump
   ○Maria Del Carmen Marin Perez、Masae Konno、Hiromu Yawo、Keiichi Inoue

1. The dynamics of two gates of pump-like channel rhodopsin, ChRmine, revealed by a combination of spectroscopic and electrophysiological studies
   Keisei Shibata、○Yuma Kawasaki、Koichiro Kishi、Shunki Takaramoto、 Ryohei Ono、 Masahiro Fukuda、 Hiromu Yawo、Hideaki Kato、 Hidefumi Akiyama、Keiichi Inoue

第12回CSJ化学フェスタ2022　2022年10月18-20日　東京

1. 新奇光駆動型イオンポンプによる塩化物イオン輸送機構
   ○石塚 智大、鈴木 花野、川﨑 佑真、今野 雅恵、村田 武士、井上 圭一

第60回日本生物物理学会年会　2022年9月28-30日　函館

1. 新奇微生物ロドプシン・ベストロドプシンのユニークな発色団レチナール異性化特性
   Unique chromophore isomerization properties of a novel microbial rhodopsin bestrhodopsin
   ○永田 崇、川﨑 佑真、今野 雅恵、長坂 勇次郎、青山 真子、片山 耕大、Andrey Rozenberg, Igor Kaczmarczyk, Donna Matzov, Moran Shalev-Benami, Oded Béjà, 神取 秀樹、井上 圭一

1. 宿主由来のレチナールを利用する共生古細菌Saccharibacteria由来Type-1ロドプシンの分子特性
   Molecular properties of Type-1 rhodopsin from Saccharibacteria that may use host-derived all-trans retinal
   ○今野 雅恵、Alexander L. Jaffe、川﨑佑真、片岡 千尋、Oded Béjà、神取 秀樹、Jillian F. Banfield、井上 圭一

1. Conversion of light-driven outward proton pump rhodopsin into inward proton pump
   ○Maria Del Carmen Marin Perez、Masae Konno、Hiromu Yawo、Keiichi Inoue

1. 磁気刺激による細胞活動制御のための磁気レシーバー・磁気刺激システムの開発
   Development of novel technique for magnetic activation of living-cell functions
   ○宝本 俊輝、八尾 寛、長坂 勇次郎、吉岡 輝、関野 正樹、井上 圭一

1. 高熱安定性光駆動型内向き H+ポンプロドプシンにおける熱安定性要因の研究
   Study on the factors contributing to the high thermal stability of thermostable light-driven inward H⁺ pump rhodopsins
   ○川﨑 佑真、今野 雅恵、井上 圭一

1. 新奇塩化物イオンポンプロドプシンの輸送メカニズム研究
   Study on the transport mechanism of the novel chloride-ion pump rhodopsin
   ○石塚 智大、鈴木 花野、川﨑 佑真、今野 雅恵、村田 武士、井上 圭一

第22回日本光生物学協会年会　2022年8月9-10日　大阪

1. 新奇微生物ロドプシン・ベストロドプシンの発色団特性とその構成的理解
   ○永田 崇、川﨑 佑真、今野 雅恵、長坂 勇次郎、青山 真子、片山 耕大、Andrey Rozenberg, Igor Kaczmarczyk, Donna Matzov, Moran Shalev-Benami, Oded Béjà, 神取 秀樹、井上 圭一

1. 土壌細菌由来新奇光駆動型Cl⁻ポンプロドプシンとそのイオン輸送機構
   ○石塚 智大、鈴木 花野、川﨑 佑真、今野 雅恵、村田 武士、井上 圭一

物性研短期研究会「理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働」　2022年7月26-27日　柏、オンライン開催

1. タンパク質内プロトン移動が微生物ロドプシンの光機能を生み出すしくみ
   ○井上 圭一
2. レチナール光異性化酵素として機能する動物ロドプシンの光吸収・反応特性の解析⁺ポンプロドプシンの高温環境下での機能活性評価と比較
   森本 直也、○永田 崇、井上 圭一

第48回生体分子科学討論会　2022年6月30-7月1日　鳥取

1. ２種類の高熱安定性光駆動型内向きH⁺ポンプロドプシンの高温環境下での機能活性評価と比較
   ○川﨑佑真、今野雅恵、井上 圭一

ISSPワークショップ：開放系トポロジーと生体・量子・統計物理　2022年3月28-30日　オンライン開催

1. 機械学習を用いたロドプシンの吸収波長予測法とオプトジェネティクスツール開発への応用
   ○井上 圭一、烏山 昌幸、神取 秀樹、竹内 一郎
2. レチナール光異性化酵素として働くロドプシンの光吸収・反応特性の解析
   森本 直也、○永田 崇、井上 圭一

日本比較生理生化学会第43回札幌大会　2021年12月4-5日　オンライン開催

1. Spectral characterization of vertebrate opsins acting as a retinal photoisomerase
   森本 直也、○永田 崇、井上 圭一

第44回日本分子生物学会年会　2021年12月1-3日　横浜

1. 機械学習による微生物ロドプシンの吸収波長予測
   ○井上 圭一、烏山 昌幸、神取 秀樹、竹内 一郎

1. Color Tuning of Microbial Rhodopsin Proteins: Combained Spectroscopic and QM/MM Modeling Studies
   ○Maria del Carmen Marin Perez、今野 雅恵、Laura Pedraza-Gonzalez、Luca De Vico、Massimo Olivucci、井上 圭一

第11回CSJ化学フェスタ2021　2021年10月19-21日　オンライン開催

1. 高温環境から発見されたシゾロドプシンの熱安定性研究
   ○川﨑 佑真、今野 雅恵、井上 圭一

第15回分子科学討論会　2021年9月18-21日　オンライン開催

1. 高温環境由来新奇シゾロドプシンの熱安定性研究
   ○川﨑 佑真、今野 雅恵、井上 圭一

第21回日本蛋白質科学会年会　2021年6月16-18日　オンライン開催

1. Methanoculleus属古細菌由来新奇シゾロドプシンの熱安定性評価
   ○川﨑 佑真、今野 雅恵、井上 圭一

第47回生体分子科学討論会　2021年6月4-5日　オンライン開催

1. Methanoculleus属アーキア由来シゾロドプシンの熱安定性研究
   ○川﨑 佑真、今野 雅恵、井上 圭一

第3回ExCELLSシンポジウム　2020年12月21日　オンライン開催

1. 理論と実験の融合による新規光遺伝学ツールの創成に向けたロドプシンタンパク質の膜内配向制御
   ○井上 圭一

日本生体エネルギー研究会第46回討論会2020金沢　2020年12月9-11日　金沢、オンライン開催

1. 海洋性細菌のCl⁻ポンプロドプシンにおける波長制御メカニズムの変異体解析
   ○永田 崇、烏山 昌幸、中島 悠、吉澤 晋、竹内 一郎、井上 圭一

1. TATロドプシンのpK_aと多量体形成の制御における保存されたグルタミン酸の役割
   ○萬年 健太郎、永田 崇、戸叶 貴也、内橋 貴之、Oded Béjà、井上 圭一
   学生ポスター発表優秀賞受賞

第43回日本分子生物学会年会　2020年12月2-4日　オンライン開催

1. 光駆動型内向きプロトンポンプ、シゾロドプシンのプロトン輸送メカニズム
   ○井上圭一、志甫谷渉、今野雅恵、樋口晶光、但馬聖也、古谷祐詞、川﨑佑真、八尾寛、川村出、神取秀樹、濡木理

第58回日本生物物理学会年会　2020年9月16-18日　オンライン開催

1. Mutational analysis of the mechanism of an absorption red shift in a marine bacterial Cl^--pumping rhodopsin
   ○永田崇、烏山昌幸、竹内一郎、中島悠、吉澤晋、井上圭一

1. Development of a light regulatory system of membrane potential in plant cells
   ○今野雅恵、八尾寛、神取秀樹、井上圭一

1. The gate-keeper role of a highly conserved helix-3 tryptophan for ion transport of the　channelrhodopsin chimera, C1C2/ChRWR
   ○長坂勇次郎、細島頌子、神取秀樹、井上圭一、八尾寛

1. Biophysical characterization of different members of TAT rhodopsins: a new group of microbial rhodopsins
   ○萬年健太郎、永田崇、Oded Béjà、井上圭一

物性研短期研究会「理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働」　2020年2月28-29日 (開催延期)　柏

1. イオン輸送型ロドプシンのチャネル／ポンプ機能スイッチング
   ○長坂勇次郎、細島頌子、井上圭一、神取秀樹、八尾寛

第42回日本分子生物学会年会　2019年12月3-6日　博多

1. ヘリオロドプシンとシゾロドプシン：２つの新奇光受容膜タンパク質ファミリーの発見とその機能、光反応
   ○井上 圭一、Oded Béjà、神取秀樹

基生研研究会「異分野融合による次世代光生物学研究会」　2019年11月7-8日　岡崎

1. ２つの新奇ロドプシン、ヘリオロドプシンとシゾロドプシンについて
   ○井上 圭一、Oded Béjà、神取秀樹

ISSPワークショップ「レチナールタンパク質の光機能発現の物理と化学」　2019年9月5-6日　柏

1. Schizorhodopsinの光駆動内向きプロトン輸送とその分子メカニズム
   ○井上 圭一、角田 聡、Manish Singh、今野 雅恵、富田 紗穂子、細島 頌子、中村 良子、渡辺 大輝、内橋 貴之、Rohit Ghai、Oded Béjà、神取 秀樹

14th Japanese-German Frontiers (JGFoS) of Science Symposium September 6-9, 2018 Kyoto, Japan

1. Microbial rhodopsin: photo-receptive membrane proteins with diverse functions
   ○Keiichi Inoue